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近亲结婚会大大增加隐性遗传病的发病率。
资料显示，血缘后代的隐性遗传病发病率是非血缘后代的150倍。
一些多基因遗传病的发病率，近亲结婚也高于非近亲结婚。
据统计，近亲结婚的孩子，先天性心脏病、无脑儿、脊髓裂等多基因疾病的发病率约为1.64%，非近亲结婚的孩子仅为0.57%。
近亲繁殖后代的早期死亡率和畸形率也较高。
近亲结婚会导致体质下降，体重下降，身高变矮。
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